Для того, что бы добавить nofollow в пункт меню, нужно перейти в — Внешний вид -> меню.
Далее в правом верхнем углу, нужно найти кнопку — Настройки экрана.

a0ecba12ee

В открывшемся меню, остается только выбрать правильный нужный нам пункт — Отношение к ссылке (XFN).

5a1db221e0

Теперь можно добавить nofollow в пункт меню.

b60ea8304a

Теперь в пункте меню будет выводиться rel=’nofollow’, осталось добавить noindex. Для этого добавляем код в functions.php

class XFN_Walker_Nav_Menu extends Walker_Nav_Menu {

	function start_el(&$output, $item, $depth, $args) {
		global $wp_query;           

		$indent = ( $depth ) ? str_repeat( "\t", $depth ) : '';

		$class_names = $value = '';

		$classes = empty( $item->classes ) ? array() : (array) $item->classes;
		$classes[] = 'menu-item-' . $item->ID;
		
		$noindex = empty( $item->xfn ) ? array() : (array) $item->xfn;

		$class_names = join( ' ', apply_filters( 'nav_menu_css_class', array_filter( $classes ), $item, $args ) );
		$class_names = ' class="' . esc_attr( $class_names ) . '"';

		$id = apply_filters( 'nav_menu_item_id', 'menu-item-'. $item->ID, $item, $args );
		$id = strlen( $id ) ? ' id="' . esc_attr( $id ) . '"' : '';

		$output .= $indent . '<li' . $id . $value . $class_names .'>';

		$attributes  = ! empty( $item->attr_title ) ? ' title="'  . esc_attr( $item->attr_title ) .'"' : '';
		$attributes .= ! empty( $item->target )     ? ' target="' . esc_attr( $item->target     ) .'"' : '';
		$attributes .= ! empty( $item->xfn )        ? ' rel="'    . esc_attr( $item->xfn        ) .'"' : '';
		$attributes .= ! empty( $item->url )        ? ' href="'   . esc_attr( $item->url        ) .'"' : '';

                // new addition for noindex tag
                if(in_array('nofollow', $noindex)) {
                    $noindex_before .= '<noindex>';
                    $noindex_after .= '</noindex>';
                }

		$item_output = $args->before;
		$item_output .= $noindex_before . '<a'. $attributes .'>';
		$item_output .= $args->link_before . apply_filters( 'the_title', $item->title, $item->ID ) . $args->link_after;
		$item_output .= '</a>' . $noindex_after;
		$item_output .= $args->after;

		$output .= apply_filters( 'walker_nav_menu_start_el', $item_output, $item, $depth, $args );
	}
}

После этого в месте где выводится меню в шаблоне, нужно добавить

'walker'=> new XFN_Walker_Nav_Menu()

Как пример:

<?php 
wp_nav_menu( array( 
  'theme_location' => 'primary',
  'fallback_cb'=> '',
  'walker'=> new XFN_Walker_Nav_Menu()
)); 
?>

Теперь в любом пункте меню, где прописано nofollow будет дописываться noindex.